高雄科工館車站位於高雄市區鐵路主線中段，站址在大順陸橋西側，屬於鐵路地下化後新增的市區車站之一。科工館車站的位置條件使車站同時面對道路系統與軌道系統的交會需求，在市區交通結構中具有清楚的銜接性。
車站地面建築外觀與民族車站採用相近的設計模式，站體形式與出入口配置呈現高度一致，彷彿一對相互對應的車站。兩站差異在地下空間的處理方式。當人們進入站內後，空間主題明顯轉換，呈現出與站名高度連結的設計取向。
地下大廳與通行空間中，裝飾元素以 DNA 螺旋鏈為主要視覺符號，透過立體構件與圖像語彙，將科學與工程的概念轉化為可被感知的空間表現。這樣的處理方式使地下空間不再只是中性的通道，而是具有明確主題識別的場域，與地面簡潔的站體形成對比。
在線路順序上，科工館車站往北銜接民族車站，延續市區中段的小站配置；往南則接續正義車站，列車逐步進入苓雅區路段。前後站距不長，但各站在空間主題上的差異，使行程中能清楚感受到站點性格的轉換。
科工館車站的特色，並非來自外觀造型，而是集中於地下空間的主題營造。透過與站名呼應的設計語言，讓這座外表低調的市區車站，在實際進入後展現出鮮明且容易辨識的空間印象。
