諦願寺是一座規模完整的佛教寺院建築群，座落於河谷與山坡之間，前方視野開闊，可對應河道空間，後方則連接層層山巒，使整個寺院與周圍地形形成明確的前低後高配置。寺院建築群依地勢展開，軸線清楚，空間層次由外而內逐步收束。
寺院整體以大型宮殿式建築為主體，不同殿宇之間穿插小型院落，形成連續但不封閉的空間結構。殿堂外觀尺度宏大，內部裝飾色彩鮮明，牆面與樑柱上可見大量浮雕、彩繪與石雕細節。這些裝飾由多地工藝者共同完成，風格並不單一，使宗教空間也同時呈現出多樣化、藝術包容性。
主要殿宇包含大雄寶殿、臥佛殿與西方三聖殿，各殿在配置與功能上有所區分。臥佛殿內供奉一尊大型木雕臥佛像，佛像以整段樟木雕刻而成，全長約7.5公尺，深約1.9公尺，整體比例明確，體量感強烈，在殿內空間中具有高度存在感。
寺院戶外廣場設置有大規模石雕群像，排列成步行動線，雕像數量達數百尊。每尊人物在表情、姿態與細節處理上皆不相同，形成一條可近距離觀察雕刻工法與造型差異的步行空間，與殿堂內部的宗教氛圍形成另一種觀看層次。
除宗教空間外，寺內亦規劃展覽性質的室內空間，分別展示書畫、玉石、木雕與各類石材收藏。石藝館中陳列約四百件不同材質與產地的石藝作品，透過分類與空間配置呈現自然紋理與形態差異，使整體寺院除了宗教功能外，也具備明確的藝術展示性質。
