澎湖孔廟座落於澎湖縣馬公市西文里，前身為清代乾隆三十一年（1766）創立的「文石書院」，是當時整個澎湖群島唯一的一所書院。澎湖通判胡建偉到任後，鑒於離島文風未開、學子赴台應考路途遙遠，遂應貢生許應元等人之請，於乾隆三十二年孟夏建成書院，因澎湖本地盛產文石，便以此特色為書院命名。文石書院的設立，象徵儒學教育正式深入澎湖，並培育了當地一代代讀書人，包括後來成為澎湖第一位進士的蔡廷蘭。
書院在日治時期歷經改建，於昭和年間轉作奉祀孔子之用，改稱「澎湖孔廟」，建築格局也隨之調整為儒學禮制空間。現存建築為清式雙層閣樓配置，包括大成殿、東廡與西廡、大成門、櫺星門、崇聖祠等構件，木結構與磚石細部仍可見閩南匠藝特徵。其中位於園區西側的魁星樓為書院時期遺構，雙層飛簷與彩繪木雕保存良好，成為孔廟園區最具辨識度的視覺地標。
園區內保存六面具有歷史價值的石碑，內容涉及書院創建、修繕、捐輸名單與規約沿革，並於民國九十二年與魁星樓一同公告為澎湖縣歷史建築，是研究澎湖科舉、教育史與宗教祭祀演變的關鍵實物。庭院中種植有榕樹、雞蛋花等老樹，搭配紅磚地坪與燕尾屋脊，散發濃厚的書院氣息，相當適合靜心散步。
孔廟為開放式園區，無設售票閘口，遊客可自由入內參觀建築群與石碑，部分殿宇空間則於祭孔活動或文化局排定展覽時開放。每年九月底前後配合大成至聖先師釋奠典禮，園區會舉行祭孔儀式，是了解澎湖儒學傳承與民間信仰的重要場域；其餘時段則以靜謐的文化空間樣貌呈現，適合搭配導覽資料慢慢觀察。
孔廟位於馬公市區東側，從中正路步行或騎車約十分鐘可達，鄰近的文澳城隍廟、西文里傳統聚落與澎湖縣政府文化局展館都可串連，安排為馬公人文半日遊的內陸路線。園區腹地不大，建議停留四十五至七十分鐘即可從容欣賞建築、石碑與庭院，再順遊周邊老社區巷弄，感受不同於海岸地景的澎湖文教風貌。對攜家帶眷的旅人來說，孔廟也是讓孩子接觸書院文化、認識儒學典禮與古蹟保存意義的合適場域，可搭配澎湖科技大學與當地文化局不定期推出的導覽解說，獲得更完整的歷史背景，讓這座離島孔廟之行不僅止於拍照打卡，而能真正帶回一段屬於澎湖的文教記憶。
