澎湖廳憲兵隊位於馬公市舊城區內，是澎湖縣登錄的歷史建築，亦是當地少數完整保留至今的日式官署建築群，建築群基地呈長方形，西側緊鄰以玄武岩堆砌的圍牆，前方還留有一座地下水池遺跡，是了解澎湖近代行政與軍事變遷的關鍵節點。整體基地不算寬闊，卻完整包含主屋、宿舍、附屬空間與庭園植栽，動線層次清楚，走入其中能感受到日治時期官署建築的格局秩序與生活機能配置。
回溯歷史，這塊地最早是清康熙年間設置的澎湖協鎮署，是清廷統理澎湖海防與軍政事務的重要據點，光緒十五年隨澎湖行政體系調整改為通判衙門，當時僅做必要的屋舍修繕，並在署旁增建監房與化善所各一處。日治時期才出現較大幅度的改建，大正末年到昭和六年間，原本的清代衙署逐步翻修為磚木造的日式建築，並改作澎湖廳憲兵分隊使用，是現今樣貌的主要來源，建築語彙也由閩南風格轉為日式樣式。
建築主體為兩層磚木造，外牆使用紅磚搭配雨淋板，屋頂覆以日式黑瓦，內部走廊以檜木地板與木窗櫺鋪陳，整體氣息沉穩；宿舍區還可見到當年沐浴與取暖兩用的磚造煙囪，是日式生活空間的重要見證。最具辨識度的是西側使用澎湖在地玄武岩疊砌的圍牆，將粗獷的火山岩材質與精細的木構建築並置，呈現出殖民時期就地取材又保留母國形式的混合特色，也是辨識本建築的重要視覺符號。
戰後這裡的角色再度轉換，民國三十四年國民政府接收後做為澎湖防衛司令部運輸組營區使用，民國四十七年因應八二三砲戰局勢改組為馬公港指揮部，長期維持軍事用途，外人不得進入。二零零二年澎湖縣政府公告為歷史建築，並陸續啟動調查研究與修復工程，二零二零年由文化局完成修復後啟用為洪根深美術館，活化成為當代藝術展演與在地藝術家駐村創作的空間，老建築有了新生命。
參觀時可循著民族路一帶散步，從中央老街轉進，沿途會經過天后宮、四眼井、施公祠等舊城遺跡，串連起來剛好半天行程，是體會馬公舊城脈絡的完整路線。建議避開正午時段，光線斜照下玄武岩圍牆與紅磚牆對比最美，也方便拍攝外觀立面細節。館內展覽會不定期更換，建議出發前查閱文化局公告，確認當期檔期、開放時間與是否有特別預約規定，以便安排行程。
