吳府殿坐落於澎湖縣馬公市井垵里十七號，靠近海岸線，是井垵聚落的角頭公廟之一，與鄰近的井垵北極殿並列為村內主要的信仰中心。廟宇主祀吳府千歲，配祀土地公。相傳吳府千歲名諱吳潛，祖籍浙江省嘉興縣，明末隨鄭成功部隊抵達澎湖，奉命駐守西嶼頭一帶，後人感念其德而立廟奉祀，王爺信仰由此世代相傳，融入井垵聚落的生活節奏中。
廟宇建築承襲典型閩南式王爺廟格局，屋脊以雙龍搶珠、福祿壽三仙剪黏裝飾，山牆與門面彩繪細緻，殿內樑架、神龕、香爐與供桌依序展開，呈現王爺廟莊嚴中帶有民俗熱鬧的氛圍。井垵地處馬公市南側海岸，緊鄰澎 201 縣道，從村內巷弄望去，廟宇與海景幾乎一線串連，廟方近年也持續整修，廟埕與廟前廣場乾淨整潔，是聚落居民日常聚會、孩童玩耍的公共空間。
王爺信仰是澎湖最具代表性的民間信仰之一。吳府殿每逢吳府千歲聖誕便會舉行祭典，依例擲筊請示神意，由爐主、頭家籌備犒軍、普渡、繞境，並有小法團演法、誦經、安符等儀式。井垵村也與鄰近的山水、嵵裡等聚落，因王爺信仰串起跨村的聯誼往來，遇上王爺巡庄或入火安座等大型典禮，常見鄰近村莊神轎齊集，廟前鑼鼓喧天。
井垵聚落本身保留澎湖典型的咾咕石老厝群、低矮石牆與菜宅，從吳府殿步行幾分鐘即可走到海邊，欣賞玄武岩台地與潮間帶景觀。村內的井垵北極殿主祀玄天上帝，廟身坐東南朝西北，於民國九十年完成重建，與吳府殿距離不遠，兩座宮廟可一起走訪，認識澎湖一村多廟的信仰結構。
參拜時建議遵循一般廟宇禮俗，先於廟埕整理儀容、再依序拜天公爐、主祀神與配祀神。澎湖廟宇普遍歡迎自由參觀，但拍照時請避免直對神像或在祭典進行時干擾儀式。停留時間約二十至三十分鐘，可一併欣賞廟內裝飾與廟前海岸視野。
行程串連方面，井垵位於馬公南環線上，可順遊嵵裡沙灘、山水沙灘、風櫃聽濤、蛇頭山遊憩區等景點，傍晚再回市區享用海鮮，是體會澎湖庶民信仰與海岸風光的精選短程路線。自馬公市區開車前往約十五分鐘，自駕、租機車皆方便。
