鐵線清水宮坐落於澎湖縣馬公市鐵線里港口旁，又稱「鐵線祖師廟」，舊名「鐵線朱王廟」，是鐵線里的公廟，主祀清水祖師，習稱「祖師廟」。本廟位於馬公南灣東岸的鐵線聚落，是了解澎湖清水祖師信仰、聚落集資建廟史的重要宮廟，也是馬公郊區規模可觀、廟貌嶄新的宗教景點之一。
鐵線里位於馬公南灣東岸，東臨澎湖水道，北鄰興仁里，南接五德里與鎖港里，西瀕馬公內灣，是馬公市郊區之中面積最小的一里。聚落沿著海岸發展，居民多以漁業與小規模農作為生。鐵線清水宮的創建年代已不可考，但有紀錄可循的最早重修工程是清光緒十七年（1891），可見廟史至少橫跨清代後期至今逾百三十年。
本廟在日治時期文化活動相當活躍。大正十一年（1922年）廟方成立「初化社虔善堂」鸞堂，鸞生輯錄勸善詩文，著有一部名為《寶世金篇》的善書，分為「禮、義、廉、恥」四卷，是研究澎湖民間宗教與漢文教育的重要文獻。戰後民國五十年（1961年）由三柱（甲）鄉老邀集里民達成共識，以每丁每月出資三十元、機動漁船每艘依淨所得抽出兩份作為重建基金，集資數年後於民國五十二年（1963）動工擴建，民國五十四年（1965）竣工，奠定戰後第一代廟貌。
民國九十年（2001年）管理委員會考量原廟地過於狹窄，決定申購廟前由國有財產局管理的海埔新生地另建新廟。當時短短幾個月內便獲鐵線里民與旅外鄉親捐簽超過一千八百萬元，展現社區強大的向心力。新廟於民國九十年同年動土，民國九十四年（2005年）竣工，總工程款達新台幣三千一百九十萬元整。新廟坐落於港口旁的開闊基地，廟前可眺望馬公內灣的水色與漁港風光，是欣賞夕陽與港邊風景的好地方。
清水祖師信仰源自福建泉州安溪，隨閩南移民傳入台灣與澎湖，台灣本島以三峽長福巖最為著名，而在澎湖則以鐵線清水宮為代表。本廟由「鐵線朱王廟」轉型為「祖師廟」的過程，反映了澎湖聚落主神改易的有趣現象，也讓清水祖師與朱府王爺信仰得以在同一座廟中延續。新廟落成已逾二十年，廟貌仍維持嶄新潔淨，是參訪澎湖近代新建宮廟工藝的好選擇。
安排馬公郊區行程時，鐵線清水宮可與鄰近的鎖港北極殿、興仁進士第、嵵裡海水浴場、山水沙灘等景點串連，體驗有別於市區的澎湖海岸聚落風情。前往參拜時請尊重宗教場域，留意港邊風大、地面濕滑，並避免在祭典期間造成交通阻礙。
